More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2329 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  89.94 
 
 		 507 aa  767    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 507 aa  966    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  89.94 
 
 		 507 aa  769    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  75.71 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.61 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.13 
 
 		 501 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  54.62 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  53.31 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.06 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  54.31 
 
 		 499 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.49 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  54.14 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  54.44 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.14 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.24 
 
 		 496 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  54.45 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  48.21 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  49.59 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  48.21 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.52 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.04 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.8 
 
 		 508 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.8 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.64 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 		 539 aa  356  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.37 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.29 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  46.73 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.1 
 
 		 468 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.7 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  39.41 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  44.69 
 
 		 528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  41.67 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  38.35 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.76 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.13 
 
 		 476 aa  276  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  51.07 
 
 		 526 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.98 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.77 
 
 		 499 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.67 
 
 		 530 aa  246  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.42 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.37 
 
 		 528 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  38.12 
 
 		 496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  39.15 
 
 		 519 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.77 
 
 		 531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.21 
 
 		 525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.98 
 
 		 457 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  37.02 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.15 
 
 		 517 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.93 
 
 		 533 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.76 
 
 		 510 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  37.02 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.7 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.99 
 
 		 524 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.65 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.03 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.39 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.35 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  40.88 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 		 514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.02 
 
 		 521 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.77 
 
 		 531 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  39.56 
 
 		 502 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  38.84 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.67 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.15 
 
 		 556 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 		 524 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.82 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  37.2 
 
 		 496 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.98 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.85 
 
 		 499 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.44 
 
 		 556 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.84 
 
 		 524 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  41.18 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.87 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.23 
 
 		 492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.99 
 
 		 533 aa  213  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  39.81 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  37.92 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.99 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.96 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 		 511 aa  209  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.88 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.2 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.28 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  40.69 
 
 		 449 aa  207  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  35.08 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.71 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  35.57 
 
 		 514 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.67 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  35.71 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.4 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  35.5 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>