More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0048 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
468 aa  894    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.76 
 
 
508 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.32 
 
 
496 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.61 
 
 
501 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.32 
 
 
501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.02 
 
 
522 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  45.81 
 
 
499 aa  329  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  44.51 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  44.51 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.16 
 
 
539 aa  325  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  45.4 
 
 
499 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  45.16 
 
 
499 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  45.66 
 
 
499 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.89 
 
 
510 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.31 
 
 
500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.99 
 
 
538 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  44.33 
 
 
519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.49 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  44.58 
 
 
493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.57 
 
 
507 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.81 
 
 
500 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.69 
 
 
507 aa  299  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.93 
 
 
490 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  45.84 
 
 
499 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.72 
 
 
490 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.67 
 
 
499 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.86 
 
 
490 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  51.32 
 
 
526 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.67 
 
 
457 aa  285  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.87 
 
 
485 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.29 
 
 
496 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  36.9 
 
 
463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  36.5 
 
 
466 aa  268  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.85 
 
 
509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  42.99 
 
 
523 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  41.13 
 
 
528 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.09 
 
 
476 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  35.85 
 
 
581 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  45.12 
 
 
449 aa  212  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.31 
 
 
514 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.33 
 
 
514 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.21 
 
 
519 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
515 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.54 
 
 
517 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 
521 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.22 
 
 
510 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.35 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.39 
 
 
504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.3 
 
 
498 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.51 
 
 
519 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
509 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  40.24 
 
 
502 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.72 
 
 
524 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.17 
 
 
533 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.57 
 
 
490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  34.22 
 
 
524 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.21 
 
 
496 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
524 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
546 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.98 
 
 
499 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 
516 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.53 
 
 
524 aa  192  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.37 
 
 
513 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.3 
 
 
521 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.63 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.3 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.81 
 
 
507 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.86 
 
 
530 aa  190  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.48 
 
 
492 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.12 
 
 
502 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.83 
 
 
528 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 
518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  36.95 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.28 
 
 
530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.2 
 
 
519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.85 
 
 
512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 
518 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  37.65 
 
 
499 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  37.63 
 
 
468 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.02 
 
 
500 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.6 
 
 
532 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
479 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.35 
 
 
501 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  41.99 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.24 
 
 
512 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  38.37 
 
 
436 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.81 
 
 
490 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.28 
 
 
533 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.78 
 
 
556 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.63 
 
 
502 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.08 
 
 
524 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.81 
 
 
480 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  37.5 
 
 
490 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  36.08 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 
507 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  30.02 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.29 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.76 
 
 
480 aa  172  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>