More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5131 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
500 aa  941    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  75.51 
 
 
507 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  75.1 
 
 
507 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  75.71 
 
 
507 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.68 
 
 
501 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  68.42 
 
 
501 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.78 
 
 
510 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  53.21 
 
 
499 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.19 
 
 
522 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  52.12 
 
 
499 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.53 
 
 
496 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.32 
 
 
538 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  52.74 
 
 
499 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.51 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  52.53 
 
 
499 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  51.21 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  49.9 
 
 
493 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  52.74 
 
 
519 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  48.91 
 
 
501 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  48.91 
 
 
501 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.44 
 
 
499 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.67 
 
 
490 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.52 
 
 
490 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.2 
 
 
539 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.37 
 
 
490 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.61 
 
 
500 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.7 
 
 
485 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.03 
 
 
468 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  47.49 
 
 
523 aa  317  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  39.04 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.13 
 
 
496 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  44.63 
 
 
528 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  41.7 
 
 
581 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  37.61 
 
 
466 aa  290  3e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.91 
 
 
509 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.71 
 
 
476 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.7 
 
 
492 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  50.97 
 
 
526 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.48 
 
 
514 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.01 
 
 
520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.06 
 
 
499 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  36.33 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.54 
 
 
530 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.35 
 
 
515 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.91 
 
 
513 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 
510 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  38.35 
 
 
496 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.33 
 
 
457 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.81 
 
 
525 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.15 
 
 
521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  37.14 
 
 
514 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.79 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.74 
 
 
509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.49 
 
 
490 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.32 
 
 
528 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  36.63 
 
 
524 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  37.76 
 
 
519 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.27 
 
 
498 aa  226  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  37.7 
 
 
522 aa  226  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.19 
 
 
519 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.55 
 
 
524 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.37 
 
 
532 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.23 
 
 
556 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.28 
 
 
521 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  39.68 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.52 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.68 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.34 
 
 
519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 
500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.66 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.02 
 
 
502 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.33 
 
 
531 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 
523 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 
499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.09 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  38.2 
 
 
530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.21 
 
 
517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.95 
 
 
531 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  42.27 
 
 
449 aa  213  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.62 
 
 
556 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.33 
 
 
524 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 
512 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.64 
 
 
516 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.43 
 
 
513 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.27 
 
 
521 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.94 
 
 
533 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  34.06 
 
 
513 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  37.88 
 
 
496 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.94 
 
 
498 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  39.11 
 
 
436 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  37.5 
 
 
502 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  33.19 
 
 
508 aa  206  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  35.31 
 
 
515 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.72 
 
 
511 aa  204  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  36.32 
 
 
510 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.82 
 
 
500 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.49 
 
 
508 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.1 
 
 
512 aa  203  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  35.41 
 
 
513 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  37.18 
 
 
514 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>