More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3313 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 499 aa  978    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  71.54 
 
 		 499 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  71.34 
 
 		 499 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  88.58 
 
 		 519 aa  825    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  76.95 
 
 		 499 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  88.98 
 
 		 499 aa  857    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  69.74 
 
 		 499 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.97 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.63 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.55 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.44 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.11 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  51.8 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  51.8 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.8 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.98 
 
 		 538 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.81 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  49.79 
 
 		 493 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.63 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.09 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.35 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.15 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.55 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.16 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.45 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.55 
 
 		 490 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.17 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.11 
 
 		 496 aa  319  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  39.96 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  39.57 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  44.8 
 
 		 523 aa  292  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.94 
 
 		 476 aa  289  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.03 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  40.66 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  45.28 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.77 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  46.1 
 
 		 526 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  40.62 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.42 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.22 
 
 		 457 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  37.38 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.98 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.16 
 
 		 521 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.37 
 
 		 525 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.87 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.1 
 
 		 499 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.86 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.18 
 
 		 515 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.96 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.74 
 
 		 521 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  41.21 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.62 
 
 		 530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.26 
 
 		 533 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.88 
 
 		 531 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.23 
 
 		 519 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.24 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.42 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.86 
 
 		 492 aa  209  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.55 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  34.22 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.79 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.8 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.07 
 
 		 513 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 		 515 aa  202  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.71 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.61 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.67 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.2 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.17 
 
 		 490 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.94 
 
 		 523 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.2 
 
 		 496 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  33.48 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.59 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  35.56 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.92 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.16 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  30 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  37.96 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.74 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  34.65 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.93 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.97 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.77 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 		 518 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  36.25 
 
 		 500 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.97 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  37.35 
 
 		 507 aa  190  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.96 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  34.47 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>