More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4460 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 509 aa  968    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  54.24 
 
 		 528 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  54.11 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  45.36 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  44.77 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  45.51 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  45.53 
 
 		 499 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  43.6 
 
 		 499 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.39 
 
 		 508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  42.58 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  42.58 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.78 
 
 		 501 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.62 
 
 		 485 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  45.51 
 
 		 519 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.8 
 
 		 510 aa  292  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.18 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.37 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  43.58 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  35.97 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.58 
 
 		 501 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.02 
 
 		 539 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.69 
 
 		 500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.68 
 
 		 496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  34.19 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.25 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  40.51 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.79 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.76 
 
 		 507 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.4 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.69 
 
 		 538 aa  263  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.58 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.47 
 
 		 490 aa  253  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.83 
 
 		 490 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.12 
 
 		 490 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.7 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  46.62 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.25 
 
 		 468 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.58 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 		 524 aa  213  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.16 
 
 		 514 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.69 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.73 
 
 		 514 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 493 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.16 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.6 
 
 		 519 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.58 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.33 
 
 		 517 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.44 
 
 		 504 aa  190  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.23 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.05 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.34 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.74 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.28 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.53 
 
 		 524 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 512 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  38.19 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.83 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.43 
 
 		 530 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.15 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  30.41 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31 
 
 		 500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.89 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.47 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 		 513 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 		 518 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.48 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.89 
 
 		 515 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  38.45 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.14 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  34.43 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  36.81 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  27.76 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.09 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  34.49 
 
 		 499 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  34.78 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  30.59 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  39.16 
 
 		 449 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  36.59 
 
 		 468 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  33.6 
 
 		 496 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  34.59 
 
 		 504 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.5 
 
 		 487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  34.4 
 
 		 504 aa  166  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.66 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  33.8 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.4 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.09 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.51 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.5 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.14 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  30.2 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.11 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>