More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6586 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  84.85 
 
 
501 aa  745    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
501 aa  949    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  68.56 
 
 
500 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.6 
 
 
507 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.13 
 
 
507 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.2 
 
 
507 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  57.84 
 
 
499 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  57 
 
 
499 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  57.23 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  56.76 
 
 
499 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  55.6 
 
 
499 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  52.18 
 
 
493 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  56.94 
 
 
519 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.86 
 
 
522 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.78 
 
 
510 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.47 
 
 
538 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.11 
 
 
499 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.93 
 
 
508 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.71 
 
 
496 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  49.9 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  49.9 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.43 
 
 
490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.5 
 
 
500 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.72 
 
 
490 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.86 
 
 
490 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.99 
 
 
539 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.61 
 
 
496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.22 
 
 
485 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  46.17 
 
 
523 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.31 
 
 
468 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  44.81 
 
 
528 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  37.61 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47 
 
 
476 aa  285  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  40.75 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  35.55 
 
 
466 aa  282  9e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.58 
 
 
509 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  50.22 
 
 
526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.69 
 
 
492 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.72 
 
 
457 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.67 
 
 
499 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.04 
 
 
531 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.17 
 
 
531 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
510 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39 
 
 
533 aa  240  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  42.19 
 
 
531 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.24 
 
 
528 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.96 
 
 
530 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.91 
 
 
513 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.98 
 
 
514 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  42.61 
 
 
449 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.09 
 
 
533 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 
515 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.27 
 
 
499 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.51 
 
 
509 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.45 
 
 
521 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 
524 aa  223  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.68 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  39.64 
 
 
535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.96 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.14 
 
 
498 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.95 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.58 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.57 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.05 
 
 
513 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.49 
 
 
514 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 
498 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.29 
 
 
507 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 
500 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.99 
 
 
490 aa  211  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.96 
 
 
502 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.4 
 
 
519 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.24 
 
 
522 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.99 
 
 
520 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.54 
 
 
515 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.58 
 
 
490 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  40.31 
 
 
526 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.66 
 
 
517 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.76 
 
 
519 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
556 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  40 
 
 
502 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
521 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  36.81 
 
 
496 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 
524 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 
556 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  35.94 
 
 
510 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.14 
 
 
479 aa  203  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.74 
 
 
504 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  36.79 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.4 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.15 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  32.73 
 
 
512 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.09 
 
 
492 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  38.34 
 
 
530 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  37.57 
 
 
490 aa  199  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  35.5 
 
 
514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 
504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 
493 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 
532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>