More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1332 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
476 aa  929    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  46.37 
 
 
499 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  46.67 
 
 
499 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.64 
 
 
508 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  44.86 
 
 
501 aa  306  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  44.86 
 
 
501 aa  306  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  46.86 
 
 
499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  45.36 
 
 
499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  45.51 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.59 
 
 
501 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.44 
 
 
496 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.86 
 
 
485 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.58 
 
 
510 aa  296  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.4 
 
 
539 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  45.08 
 
 
493 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.24 
 
 
522 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47 
 
 
501 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  44.49 
 
 
519 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.12 
 
 
490 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.74 
 
 
500 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.67 
 
 
500 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.94 
 
 
499 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.38 
 
 
490 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.22 
 
 
507 aa  267  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  37.04 
 
 
463 aa  264  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.8 
 
 
490 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  36.36 
 
 
466 aa  259  9e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.54 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  41.25 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  40.71 
 
 
528 aa  253  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.9 
 
 
507 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.68 
 
 
507 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  37.91 
 
 
581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.46 
 
 
538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.58 
 
 
509 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.27 
 
 
457 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.26 
 
 
479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.8 
 
 
519 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.61 
 
 
468 aa  210  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.11 
 
 
519 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.22 
 
 
514 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  43.71 
 
 
526 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 
520 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.76 
 
 
514 aa  206  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.58 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 
509 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 
521 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.97 
 
 
510 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
524 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.69 
 
 
531 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 
513 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.26 
 
 
533 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.66 
 
 
499 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.09 
 
 
492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.84 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.34 
 
 
498 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.48 
 
 
496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 
517 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 
514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.46 
 
 
507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.17 
 
 
493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 
515 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.74 
 
 
528 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
499 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.31 
 
 
531 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 
502 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.54 
 
 
533 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.51 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.99 
 
 
497 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  38.82 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.33 
 
 
501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  37.65 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.72 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  37.34 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.84 
 
 
524 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.83 
 
 
511 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 
524 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  38.75 
 
 
449 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 
532 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  35.08 
 
 
497 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.43 
 
 
521 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.98 
 
 
499 aa  170  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.92 
 
 
542 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.1 
 
 
499 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.87 
 
 
517 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.79 
 
 
499 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.12 
 
 
500 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.53 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.96 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.56 
 
 
519 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  35.12 
 
 
495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.92 
 
 
506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.2 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.14 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.39 
 
 
492 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.16 
 
 
523 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.55 
 
 
504 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>