More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07370 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  100 
 
 
500 aa  961    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.75 
 
 
473 aa  229  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  38.42 
 
 
497 aa  223  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.91 
 
 
459 aa  223  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  40.28 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.53 
 
 
504 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.53 
 
 
494 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40 
 
 
481 aa  213  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.07 
 
 
526 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.1 
 
 
495 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.67 
 
 
480 aa  210  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.94 
 
 
485 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  38.94 
 
 
485 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.94 
 
 
485 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.22 
 
 
470 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.56 
 
 
536 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.51 
 
 
471 aa  206  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.71 
 
 
487 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  40.91 
 
 
558 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.41 
 
 
495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.35 
 
 
497 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.7 
 
 
480 aa  197  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  38.2 
 
 
473 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.7 
 
 
483 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.36 
 
 
485 aa  183  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  40.91 
 
 
576 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  34.99 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.95 
 
 
499 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  36.07 
 
 
587 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.86 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.5 
 
 
465 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 
499 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  39.76 
 
 
526 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.45 
 
 
532 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  36.4 
 
 
502 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.96 
 
 
490 aa  140  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.06 
 
 
501 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  34.34 
 
 
535 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  38.89 
 
 
383 aa  139  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  32.92 
 
 
496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.81 
 
 
501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 
529 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  30.6 
 
 
514 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.38 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.54 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  34.06 
 
 
503 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.94 
 
 
525 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.97 
 
 
502 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.08 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
556 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.13 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31 
 
 
510 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.32 
 
 
515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  29.38 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.71 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.08 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.32 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.32 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.34 
 
 
515 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.34 
 
 
515 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33 
 
 
567 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.68 
 
 
510 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.65 
 
 
515 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.88 
 
 
492 aa  127  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  29.84 
 
 
508 aa  126  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.57 
 
 
502 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  37.9 
 
 
533 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.45 
 
 
524 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.85 
 
 
514 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  31.41 
 
 
499 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  34.4 
 
 
507 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  23.39 
 
 
499 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.14 
 
 
515 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.14 
 
 
515 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 
520 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.23 
 
 
499 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  33.11 
 
 
493 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  26.92 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  30.85 
 
 
512 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
514 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  32.93 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.81 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  31.86 
 
 
499 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 
531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.03 
 
 
511 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.02 
 
 
500 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.41 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  30.73 
 
 
512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.35 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  36.19 
 
 
495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  31.21 
 
 
514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.94 
 
 
496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.62 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.62 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>