More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1015 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  100 
 
 
476 aa  936    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.7 
 
 
499 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.88 
 
 
501 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.14 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  48.14 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.14 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.78 
 
 
485 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  47.93 
 
 
481 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.07 
 
 
470 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  47.7 
 
 
497 aa  346  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  48.73 
 
 
473 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.03 
 
 
473 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  47.86 
 
 
490 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.82 
 
 
494 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.52 
 
 
465 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.67 
 
 
471 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.1 
 
 
459 aa  293  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.38 
 
 
483 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.58 
 
 
495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.73 
 
 
511 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.08 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.44 
 
 
480 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.49 
 
 
487 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  41.13 
 
 
533 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.51 
 
 
536 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
504 aa  231  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.79 
 
 
495 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41 
 
 
525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  36.51 
 
 
558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  40.61 
 
 
534 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  35.35 
 
 
506 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  34.99 
 
 
500 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.68 
 
 
499 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.61 
 
 
480 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.53 
 
 
526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.55 
 
 
530 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.99 
 
 
515 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  32.55 
 
 
522 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.12 
 
 
517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.61 
 
 
517 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.75 
 
 
524 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 
529 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  32.96 
 
 
499 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.22 
 
 
510 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  31.25 
 
 
530 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.88 
 
 
492 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  35.46 
 
 
531 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.83 
 
 
499 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  35.59 
 
 
531 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  35.59 
 
 
531 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  35.59 
 
 
531 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  35.59 
 
 
531 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  35.59 
 
 
531 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  35.59 
 
 
531 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  35.59 
 
 
526 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.98 
 
 
492 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.93 
 
 
499 aa  156  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.73 
 
 
528 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 
500 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.88 
 
 
509 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  31.75 
 
 
496 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.77 
 
 
494 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.97 
 
 
524 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.46 
 
 
499 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  31.35 
 
 
512 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.8 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.68 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.68 
 
 
494 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  33.55 
 
 
499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.84 
 
 
492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.82 
 
 
503 aa  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.76 
 
 
490 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  29.57 
 
 
466 aa  153  8e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  32.31 
 
 
504 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 
494 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  29.33 
 
 
463 aa  152  8.999999999999999e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  32.31 
 
 
504 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.34 
 
 
533 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  32.08 
 
 
504 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.38 
 
 
524 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.4 
 
 
521 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.03 
 
 
504 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
499 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.62 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.83 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.52 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.76 
 
 
521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.35 
 
 
523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  34.96 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.61 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  27.97 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.17 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.34 
 
 
499 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 
519 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.78 
 
 
457 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.53 
 
 
496 aa  147  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 
480 aa  146  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>