More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0670 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  100 
 
 
558 aa  1023    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.38 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  54.67 
 
 
576 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.7 
 
 
526 aa  356  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.21 
 
 
504 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.86 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  42.35 
 
 
587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  44.86 
 
 
490 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45 
 
 
485 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  39.79 
 
 
497 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  42.75 
 
 
500 aa  247  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  42.15 
 
 
473 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.36 
 
 
459 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.97 
 
 
485 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  40.97 
 
 
485 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.97 
 
 
485 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.97 
 
 
480 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.33 
 
 
494 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.91 
 
 
471 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.76 
 
 
481 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  44.06 
 
 
526 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.43 
 
 
473 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.36 
 
 
470 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.57 
 
 
465 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.59 
 
 
499 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.7 
 
 
480 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  41.06 
 
 
533 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.28 
 
 
497 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  38.58 
 
 
476 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.06 
 
 
495 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.9 
 
 
487 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.75 
 
 
511 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.9 
 
 
532 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.33 
 
 
525 aa  174  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.64 
 
 
501 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  39.44 
 
 
383 aa  162  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.94 
 
 
483 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.55 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.89 
 
 
515 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.76 
 
 
556 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
556 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
499 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.73 
 
 
499 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.18 
 
 
523 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.41 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  27.47 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.09 
 
 
490 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.94 
 
 
511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 
499 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.17 
 
 
499 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.88 
 
 
524 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.38 
 
 
499 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  28.25 
 
 
524 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  23.53 
 
 
499 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.11 
 
 
502 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32 
 
 
506 aa  136  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.11 
 
 
513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.32 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  36.93 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  29.23 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  23.4 
 
 
499 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.77 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  31.88 
 
 
499 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.55 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.7 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.45 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.35 
 
 
504 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.88 
 
 
512 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.3 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.3 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.3 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  31.41 
 
 
499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.3 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.37 
 
 
524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.92 
 
 
528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.49 
 
 
513 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.88 
 
 
504 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 
531 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  28.36 
 
 
515 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  30.7 
 
 
533 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 
490 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.44 
 
 
524 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.12 
 
 
494 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.1 
 
 
515 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.45 
 
 
518 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.5 
 
 
510 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.52 
 
 
529 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  27.8 
 
 
463 aa  125  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  29.46 
 
 
512 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.95 
 
 
496 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 
499 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.1 
 
 
515 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  32.21 
 
 
499 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  33.6 
 
 
535 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>