More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4268 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
494 aa  941    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  67 
 
 
497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  60.85 
 
 
490 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  58.01 
 
 
533 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.84 
 
 
497 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.8 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.72 
 
 
459 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.05 
 
 
511 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.44 
 
 
487 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.36 
 
 
485 aa  346  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.39 
 
 
473 aa  336  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.89 
 
 
470 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  49.12 
 
 
473 aa  329  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.58 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  47.58 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.58 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  46.22 
 
 
481 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.97 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  46.22 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 
499 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  49.54 
 
 
534 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.55 
 
 
471 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.51 
 
 
504 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.81 
 
 
483 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.59 
 
 
536 aa  279  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.71 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.15 
 
 
501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.5 
 
 
517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  43.99 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 
524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.65 
 
 
495 aa  233  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.57 
 
 
510 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.17 
 
 
524 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.31 
 
 
526 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.51 
 
 
533 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.15 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 
515 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 
519 aa  220  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.57 
 
 
500 aa  217  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.03 
 
 
499 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  38.23 
 
 
499 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  32.42 
 
 
524 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  45.39 
 
 
525 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 
517 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.03 
 
 
499 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.14 
 
 
530 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.38 
 
 
492 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
513 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.66 
 
 
530 aa  203  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  37.35 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.39 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.13 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.84 
 
 
532 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.15 
 
 
494 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  33.53 
 
 
514 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.15 
 
 
524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.32 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 
499 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.14 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.15 
 
 
499 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  40.74 
 
 
558 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 
494 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 
494 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  37.5 
 
 
496 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.8 
 
 
500 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.13 
 
 
528 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.4 
 
 
512 aa  194  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 
490 aa  194  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  35.87 
 
 
587 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 
522 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  40.48 
 
 
576 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.48 
 
 
492 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 
502 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.26 
 
 
532 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.95 
 
 
512 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 
498 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.24 
 
 
511 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  37.42 
 
 
499 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.73 
 
 
512 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 
521 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  34.59 
 
 
515 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.83 
 
 
499 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  33.47 
 
 
508 aa  186  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.67 
 
 
556 aa  186  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  30.75 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.83 
 
 
499 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.91 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  35.99 
 
 
493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.72 
 
 
533 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 
523 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.98 
 
 
501 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.22 
 
 
492 aa  182  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.78 
 
 
546 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.85 
 
 
512 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 
501 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.32 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.92 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 
518 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>