More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13470 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.97 
 
 
485 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  75.05 
 
 
473 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  78.97 
 
 
485 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  903    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.97 
 
 
485 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.22 
 
 
470 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.09 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60 
 
 
483 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  56.45 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.07 
 
 
465 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.11 
 
 
485 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.22 
 
 
480 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  49.15 
 
 
497 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  47.82 
 
 
476 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.03 
 
 
494 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  48.19 
 
 
490 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.84 
 
 
499 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.74 
 
 
497 aa  292  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.72 
 
 
487 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.38 
 
 
501 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.03 
 
 
495 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.61 
 
 
511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  43.59 
 
 
533 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.12 
 
 
459 aa  256  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  42.96 
 
 
534 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.95 
 
 
504 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.46 
 
 
536 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.35 
 
 
495 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.38 
 
 
526 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.33 
 
 
500 aa  205  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  40.93 
 
 
558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.37 
 
 
480 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
524 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 
515 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.26 
 
 
499 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 
529 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 
519 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  35.83 
 
 
493 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  36.45 
 
 
499 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.74 
 
 
524 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  38.13 
 
 
525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 
524 aa  166  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.1 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  35 
 
 
496 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  33.63 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.43 
 
 
519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.8 
 
 
521 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.61 
 
 
501 aa  163  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
528 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.44 
 
 
490 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.3 
 
 
499 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.41 
 
 
513 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.6 
 
 
490 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 
531 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.53 
 
 
502 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.57 
 
 
524 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  35.02 
 
 
499 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 
499 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.13 
 
 
499 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.39 
 
 
511 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.56 
 
 
508 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.51 
 
 
514 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.43 
 
 
530 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.72 
 
 
512 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.25 
 
 
510 aa  156  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  38.24 
 
 
482 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.32 
 
 
492 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  36.34 
 
 
499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 
499 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 
525 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  35.68 
 
 
587 aa  153  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.17 
 
 
531 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.2 
 
 
532 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  32.96 
 
 
499 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
500 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  39.92 
 
 
526 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.38 
 
 
524 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.37 
 
 
513 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.12 
 
 
485 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.04 
 
 
499 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 
490 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.55 
 
 
514 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  35.57 
 
 
519 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.68 
 
 
492 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.52 
 
 
492 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.67 
 
 
524 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.55 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  36.48 
 
 
576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  31.76 
 
 
466 aa  148  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 
501 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.46 
 
 
499 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
499 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.3 
 
 
498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.33 
 
 
499 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  34.18 
 
 
487 aa  147  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 
532 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.06 
 
 
504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  30.96 
 
 
508 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.29 
 
 
510 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>