More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  100 
 
 		 481 aa  928    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.34 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.97 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.7 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  56.98 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.6 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  54.6 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.6 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.03 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.82 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.04 
 
 		 485 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  47.92 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  49.39 
 
 		 490 aa  342  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  45.42 
 
 		 497 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.79 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.02 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.24 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.54 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.75 
 
 		 487 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.86 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.25 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.49 
 
 		 497 aa  279  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  41.71 
 
 		 533 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.43 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.7 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.71 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.35 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  42.03 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.63 
 
 		 526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.83 
 
 		 499 aa  210  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  39.56 
 
 		 558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.68 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.16 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.09 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  35.95 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  42.15 
 
 		 525 aa  186  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  37.37 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.75 
 
 		 524 aa  182  9.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.93 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  36.72 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.92 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.51 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.03 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  30.72 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.73 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.49 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.38 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.89 
 
 		 501 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.36 
 
 		 510 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.1 
 
 		 556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  33.55 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.86 
 
 		 507 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.35 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.62 
 
 		 506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  28.89 
 
 		 466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.12 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  34.47 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.27 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  34.86 
 
 		 499 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.78 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  32.46 
 
 		 508 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.48 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  35.7 
 
 		 501 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  35.7 
 
 		 501 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.36 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 		 490 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.54 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.11 
 
 		 527 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.39 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.18 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.7 
 
 		 490 aa  160  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.3 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.88 
 
 		 514 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.66 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.37 
 
 		 530 aa  156  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  35.03 
 
 		 587 aa  156  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.56 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  35.53 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.18 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.36 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.13 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.23 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.75 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.4 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  35.15 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>