More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1140 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  100 
 
 		 533 aa  980    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  65.38 
 
 		 497 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.01 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  55.14 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.28 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.22 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.66 
 
 		 485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.76 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.92 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.9 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.9 
 
 		 480 aa  299  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.83 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  43.72 
 
 		 473 aa  290  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.01 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.25 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  42.01 
 
 		 481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.25 
 
 		 504 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.25 
 
 		 499 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.18 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  42.18 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.18 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  47.86 
 
 		 534 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  41.7 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.83 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.11 
 
 		 495 aa  249  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.84 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  44.22 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.52 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.54 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.35 
 
 		 515 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.53 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.74 
 
 		 526 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.74 
 
 		 524 aa  201  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.54 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.75 
 
 		 528 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  41.39 
 
 		 558 aa  197  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.17 
 
 		 500 aa  196  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.08 
 
 		 498 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.83 
 
 		 492 aa  193  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.08 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.34 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35 
 
 		 530 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  38.08 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.91 
 
 		 516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.09 
 
 		 525 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.58 
 
 		 520 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.06 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.58 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.07 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.21 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.04 
 
 		 510 aa  180  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  32.53 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  29.1 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  38.44 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.97 
 
 		 499 aa  177  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.09 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.16 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.31 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  31.34 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  33.2 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.85 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.91 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.78 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.74 
 
 		 525 aa  173  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.27 
 
 		 515 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25 
 
 		 499 aa  173  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.22 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.23 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.8 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.01 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.98 
 
 		 506 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.53 
 
 		 504 aa  171  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.83 
 
 		 507 aa  170  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.84 
 
 		 496 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.83 
 
 		 511 aa  169  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.66 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.9 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.56 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.75 
 
 		 494 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  32.27 
 
 		 463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.65 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.23 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  27.73 
 
 		 499 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.24 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.55 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  34.97 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  37.93 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.59 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  34.44 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  34.79 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>