More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0986 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 487 aa  938    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  54.18 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  53.51 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.44 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.58 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.66 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  50.1 
 
 		 533 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.27 
 
 		 497 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.91 
 
 		 511 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.7 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.4 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.57 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.36 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  46.36 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.36 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  48.75 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  49.12 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  46.95 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.8 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.23 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.64 
 
 		 471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.83 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.15 
 
 		 480 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.4 
 
 		 504 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.57 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.18 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.69 
 
 		 495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.71 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  45.24 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.37 
 
 		 526 aa  236  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.23 
 
 		 502 aa  224  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.87 
 
 		 480 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  42.06 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 515 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.84 
 
 		 517 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  37.79 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  38.87 
 
 		 576 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  37.02 
 
 		 499 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  35.76 
 
 		 496 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.01 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.68 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.98 
 
 		 530 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.85 
 
 		 519 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 		 499 aa  191  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.79 
 
 		 499 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  37.04 
 
 		 499 aa  189  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  37.37 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.43 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.41 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.01 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.76 
 
 		 532 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  34.1 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.89 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.31 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 		 556 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.27 
 
 		 556 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  42.83 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.8 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.25 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  36.21 
 
 		 510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.43 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.98 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  34.66 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  36.63 
 
 		 514 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  30.5 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.17 
 
 		 512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 		 494 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.26 
 
 		 524 aa  183  7e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.62 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.6 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  34.67 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.14 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 		 529 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.41 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.46 
 
 		 524 aa  177  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  35.64 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.44 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.22 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.62 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.63 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  36.02 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.84 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  34.96 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  34.96 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  34.72 
 
 		 514 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.97 
 
 		 499 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  33.77 
 
 		 510 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  34.96 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  34.96 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  34.96 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  30.54 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>