More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0877 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 471 aa  885    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  60.75 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.7 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  58.28 
 
 		 485 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.28 
 
 		 485 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.28 
 
 		 485 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.95 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  57.7 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.77 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.91 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.8 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.35 
 
 		 480 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  48.78 
 
 		 490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  48.3 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.96 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  49.24 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.66 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.3 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.85 
 
 		 501 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.06 
 
 		 495 aa  279  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.04 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.66 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.71 
 
 		 497 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  41.94 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.3 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.09 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.84 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  43.28 
 
 		 558 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.28 
 
 		 526 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  44.47 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.5 
 
 		 536 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.75 
 
 		 524 aa  193  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  43.12 
 
 		 525 aa  193  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.26 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.98 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.9 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  34.44 
 
 		 499 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.33 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  36.06 
 
 		 587 aa  167  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  37.33 
 
 		 576 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.37 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  34.96 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.76 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.56 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.06 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.09 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  35.41 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  31 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  35.46 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  35.46 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 		 524 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.71 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  33.2 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.55 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.84 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 		 528 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.26 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.66 
 
 		 519 aa  153  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.67 
 
 		 514 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  29.93 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.19 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  34.61 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  38.48 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.47 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.82 
 
 		 513 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.51 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  32.01 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.99 
 
 		 521 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.61 
 
 		 504 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.67 
 
 		 529 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.54 
 
 		 511 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.18 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  33.49 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.17 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.41 
 
 		 494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  26.64 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  35.9 
 
 		 499 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 		 506 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.45 
 
 		 508 aa  147  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  32.62 
 
 		 493 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.48 
 
 		 504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 		 490 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.13 
 
 		 519 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.26 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.17 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.26 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 		 525 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.84 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.03 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.29 
 
 		 501 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.78 
 
 		 514 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>