More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4463 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 485 aa  908    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.78 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.55 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  54.22 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  55.22 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  56.26 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.22 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  55.22 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  54.12 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  55.04 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.72 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.8 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.16 
 
 		 494 aa  359  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  51.78 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.3 
 
 		 483 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.3 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.46 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.94 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.7 
 
 		 487 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.73 
 
 		 459 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.35 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.7 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.74 
 
 		 536 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.36 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.14 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  54.74 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  48.14 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.44 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  44.29 
 
 		 558 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.02 
 
 		 495 aa  229  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.5 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.39 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.94 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  45.76 
 
 		 525 aa  209  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.02 
 
 		 519 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.36 
 
 		 500 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  38.57 
 
 		 499 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  40.59 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.31 
 
 		 529 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.22 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 		 532 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.01 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.9 
 
 		 499 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.97 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.38 
 
 		 499 aa  189  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 		 499 aa  187  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  34.92 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 		 499 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  39.56 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  35.67 
 
 		 522 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  37.08 
 
 		 514 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.25 
 
 		 490 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.16 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.15 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.66 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  35.2 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  32.03 
 
 		 512 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35.85 
 
 		 503 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  38.55 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.31 
 
 		 524 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  36.99 
 
 		 535 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.71 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  35.71 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  27.36 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.57 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.03 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 		 513 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.62 
 
 		 496 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.77 
 
 		 556 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 533 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.27 
 
 		 513 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  34.77 
 
 		 499 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  37.32 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  34.78 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.95 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.98 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  35.28 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 		 556 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.74 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.35 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.03 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.46 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  35.28 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.71 
 
 		 515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.71 
 
 		 515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  34.71 
 
 		 515 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.61 
 
 		 524 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  33.27 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  26.47 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.5 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  34.4 
 
 		 504 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  35.28 
 
 		 510 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>