More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2619 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
536 aa  1033    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.06 
 
 
504 aa  609  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.13 
 
 
526 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  43.48 
 
 
497 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.63 
 
 
495 aa  302  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.59 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.12 
 
 
485 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  44.08 
 
 
490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  42.86 
 
 
576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  41.77 
 
 
533 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.82 
 
 
495 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.66 
 
 
459 aa  263  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.93 
 
 
511 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  45.14 
 
 
558 aa  257  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.5 
 
 
487 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.8 
 
 
480 aa  246  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.29 
 
 
497 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40 
 
 
481 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  42.49 
 
 
473 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.3 
 
 
485 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  41.3 
 
 
485 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.3 
 
 
485 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.21 
 
 
470 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  40.46 
 
 
476 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  36.93 
 
 
587 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.08 
 
 
473 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.29 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  46.45 
 
 
526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.4 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.82 
 
 
500 aa  209  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.53 
 
 
525 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.52 
 
 
483 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.04 
 
 
471 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.22 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
510 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.73 
 
 
501 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.54 
 
 
532 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  33.83 
 
 
499 aa  180  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  34.78 
 
 
499 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  40.56 
 
 
534 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 
502 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.47 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.04 
 
 
499 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 
499 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.83 
 
 
513 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.48 
 
 
509 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.76 
 
 
499 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.59 
 
 
504 aa  169  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.49 
 
 
492 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.08 
 
 
499 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.32 
 
 
533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.4 
 
 
494 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.84 
 
 
492 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.52 
 
 
519 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.12 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  27.02 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  29.32 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
494 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 
499 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.31 
 
 
515 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.24 
 
 
496 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.09 
 
 
494 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  35.76 
 
 
501 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  35.76 
 
 
501 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.67 
 
 
517 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.09 
 
 
494 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  35.77 
 
 
502 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 
501 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.55 
 
 
492 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.21 
 
 
530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 
500 aa  156  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
521 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  32.9 
 
 
383 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  36.93 
 
 
499 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.87 
 
 
490 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.51 
 
 
512 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  34.04 
 
 
512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.89 
 
 
512 aa  153  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  36.17 
 
 
502 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.86 
 
 
498 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.63 
 
 
480 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.38 
 
 
516 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 
528 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 
496 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  33.8 
 
 
530 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  34.77 
 
 
499 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.73 
 
 
521 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.85 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  30.49 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.71 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.34 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.61 
 
 
514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.49 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.58 
 
 
496 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.75 
 
 
500 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 
546 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.97 
 
 
532 aa  146  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 
524 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>