More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1144 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
485 aa  928    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  78.97 
 
 
473 aa  659    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  76.49 
 
 
473 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  928    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
485 aa  928    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.14 
 
 
470 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.15 
 
 
471 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.4 
 
 
483 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  54.36 
 
 
481 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.01 
 
 
465 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.97 
 
 
485 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  48.15 
 
 
497 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  46.94 
 
 
476 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.02 
 
 
480 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  46.77 
 
 
490 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.79 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.49 
 
 
499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.63 
 
 
497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.01 
 
 
459 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.55 
 
 
501 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.87 
 
 
495 aa  276  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.3 
 
 
487 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.15 
 
 
511 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  42.28 
 
 
533 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.25 
 
 
536 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.32 
 
 
504 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  39.85 
 
 
534 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.52 
 
 
500 aa  207  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.16 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.55 
 
 
526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  40.19 
 
 
558 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.21 
 
 
480 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.48 
 
 
525 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.14 
 
 
524 aa  167  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  35.16 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 
524 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.52 
 
 
513 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  34.02 
 
 
499 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.4 
 
 
528 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.22 
 
 
490 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  35.02 
 
 
493 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.66 
 
 
524 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.88 
 
 
515 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  38.1 
 
 
576 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.91 
 
 
529 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32.98 
 
 
506 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35.15 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.48 
 
 
499 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  34.98 
 
 
587 aa  156  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.11 
 
 
510 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 
523 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.71 
 
 
532 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  33 
 
 
514 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  31.6 
 
 
530 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.05 
 
 
490 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.63 
 
 
508 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  34.36 
 
 
513 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.92 
 
 
502 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  40.38 
 
 
526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.75 
 
 
501 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.49 
 
 
519 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.26 
 
 
514 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
531 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  34.23 
 
 
487 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 
531 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  38.53 
 
 
532 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 
524 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30.71 
 
 
524 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.36 
 
 
499 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.98 
 
 
519 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  36.02 
 
 
482 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  32.96 
 
 
499 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  28.86 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.88 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  28.49 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  31.08 
 
 
508 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.52 
 
 
500 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.76 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.36 
 
 
490 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 
498 aa  147  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  32.54 
 
 
535 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  34.44 
 
 
531 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 
512 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  34.44 
 
 
531 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  34.44 
 
 
531 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  33.33 
 
 
526 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  34.44 
 
 
531 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  33.56 
 
 
499 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  34.44 
 
 
531 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  34.44 
 
 
531 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.9 
 
 
515 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.41 
 
 
462 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 
520 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  32.48 
 
 
510 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  34.44 
 
 
531 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.9 
 
 
515 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.9 
 
 
510 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.68 
 
 
496 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.44 
 
 
511 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>