More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0523 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1165    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.29 
 
 
495 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  43.3 
 
 
558 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.12 
 
 
526 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.93 
 
 
536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  37.8 
 
 
576 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.86 
 
 
504 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  33.9 
 
 
497 aa  232  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  41.36 
 
 
383 aa  226  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 
494 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  34.56 
 
 
490 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.45 
 
 
500 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  34.54 
 
 
485 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.54 
 
 
485 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.54 
 
 
485 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
473 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.6 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 
495 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 
471 aa  179  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  33.53 
 
 
473 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.94 
 
 
511 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  34.61 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 
470 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.6 
 
 
480 aa  174  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.7 
 
 
487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  32.4 
 
 
533 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.09 
 
 
480 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.72 
 
 
485 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.61 
 
 
497 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  33.6 
 
 
526 aa  151  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.75 
 
 
499 aa  144  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.22 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  36.24 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  30.32 
 
 
476 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.65 
 
 
483 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 
465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  29.8 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.92 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  29.67 
 
 
499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.14 
 
 
504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.11 
 
 
511 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  32.12 
 
 
525 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.29 
 
 
516 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.73 
 
 
511 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.18 
 
 
515 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  33.17 
 
 
532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25 
 
 
502 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.19 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  31.45 
 
 
499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.24 
 
 
523 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.28 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  27.7 
 
 
463 aa  115  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.29 
 
 
524 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  29.83 
 
 
499 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.73 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  25.69 
 
 
508 aa  111  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.83 
 
 
519 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  27.74 
 
 
513 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.59 
 
 
499 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.87 
 
 
487 aa  110  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.41 
 
 
556 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.23 
 
 
499 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  25.1 
 
 
466 aa  107  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.89 
 
 
509 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.04 
 
 
492 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.37 
 
 
513 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  25.89 
 
 
499 aa  107  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  28.57 
 
 
514 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  23.44 
 
 
499 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
496 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  25.19 
 
 
525 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.9 
 
 
499 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.59 
 
 
499 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  29.75 
 
 
530 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  28.9 
 
 
514 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  28.7 
 
 
507 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.23 
 
 
556 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  28.9 
 
 
514 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.58 
 
 
492 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  28.9 
 
 
514 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  28.9 
 
 
514 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  28.9 
 
 
514 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.6 
 
 
518 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.45 
 
 
494 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  27.5 
 
 
492 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.26 
 
 
533 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.23 
 
 
524 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  28.88 
 
 
499 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2660  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.72 
 
 
513 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00741118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.38 
 
 
457 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.27 
 
 
521 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.4 
 
 
494 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.53 
 
 
523 aa  100  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.73 
 
 
521 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  29.25 
 
 
519 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  22.85 
 
 
499 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  26.04 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.42 
 
 
490 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.34 
 
 
532 aa  99.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>