More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  100 
 
 		 576 aa  1060    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  52.98 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.52 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.35 
 
 		 526 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.64 
 
 		 504 aa  319  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.22 
 
 		 536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  40.54 
 
 		 490 aa  253  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  38.22 
 
 		 587 aa  249  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  40.99 
 
 		 497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.15 
 
 		 459 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.97 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.63 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.42 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  41.41 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.55 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.91 
 
 		 497 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.77 
 
 		 480 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.8 
 
 		 499 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.65 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  39.42 
 
 		 485 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.42 
 
 		 485 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.42 
 
 		 485 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.06 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.16 
 
 		 480 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  38.07 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  35.51 
 
 		 533 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.78 
 
 		 470 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.63 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  39.35 
 
 		 476 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.52 
 
 		 481 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  37.87 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.65 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 		 483 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  38.92 
 
 		 532 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  37.9 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.22 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.21 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  31.64 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.15 
 
 		 515 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.19 
 
 		 504 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.19 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  32.05 
 
 		 499 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.19 
 
 		 504 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.3 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  23.14 
 
 		 499 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.77 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.98 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  22.31 
 
 		 499 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.26 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.53 
 
 		 490 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.2 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 		 546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  26.92 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  28.6 
 
 		 492 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  31.61 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.95 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.26 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.64 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  32.32 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.8 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  27.11 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  31.73 
 
 		 462 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  30.57 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.04 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.57 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.74 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  28.86 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  28.87 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.18 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.6 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  30.16 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  24.03 
 
 		 466 aa  108  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  31.3 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.6 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 		 515 aa  107  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.31 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.43 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.19 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.47 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.21 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.21 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  26.52 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  29.28 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  31.51 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.91 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  24.95 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 		 494 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.16 
 
 		 515 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.16 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.16 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.16 
 
 		 515 aa  104  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>