More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3074 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 526 aa  966    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.14 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.65 
 
 		 504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  50.9 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.09 
 
 		 536 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  51.3 
 
 		 576 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  48.61 
 
 		 490 aa  276  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  42.91 
 
 		 497 aa  276  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  40.12 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.8 
 
 		 485 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  45.53 
 
 		 500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.53 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.02 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.65 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  48.23 
 
 		 526 aa  239  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.09 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.44 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  42.77 
 
 		 473 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.11 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.9 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.47 
 
 		 497 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  42.53 
 
 		 481 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.14 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.71 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.16 
 
 		 485 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  42.16 
 
 		 485 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.16 
 
 		 485 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.64 
 
 		 511 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.05 
 
 		 499 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.25 
 
 		 532 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  45.29 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  38.91 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.62 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.12 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.1 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.22 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 		 519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  36.73 
 
 		 383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  33.21 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  40.46 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.43 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.26 
 
 		 509 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.4 
 
 		 502 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  36.03 
 
 		 499 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.01 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.66 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.26 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32.94 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.09 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.73 
 
 		 513 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.07 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 		 494 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  31.62 
 
 		 496 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.38 
 
 		 524 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.09 
 
 		 494 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.78 
 
 		 493 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.08 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.3 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.76 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  37.99 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.53 
 
 		 502 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.11 
 
 		 508 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.11 
 
 		 511 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  32.53 
 
 		 510 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  33.41 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  33.41 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  33.41 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  33.41 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.71 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.41 
 
 		 515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  33.46 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 		 496 aa  136  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  31.5 
 
 		 514 aa  136  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  34.87 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.9 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.94 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.2 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  29.87 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  32.49 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  35.34 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.33 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  32.49 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  32.49 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.71 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.51 
 
 		 501 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.05 
 
 		 499 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  32.49 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.46 
 
 		 515 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.46 
 
 		 515 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.46 
 
 		 515 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  32.4 
 
 		 496 aa  133  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  29.14 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>