More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2910 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
504 aa  977    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  67.06 
 
 
536 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.98 
 
 
526 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.33 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  42.94 
 
 
497 aa  306  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  43.79 
 
 
576 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.56 
 
 
494 aa  280  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  45.75 
 
 
558 aa  269  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  42.52 
 
 
490 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.83 
 
 
485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.95 
 
 
511 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  41.47 
 
 
533 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.06 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.6 
 
 
495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.94 
 
 
497 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.7 
 
 
481 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.49 
 
 
480 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  42.95 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.4 
 
 
487 aa  233  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.6 
 
 
470 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.77 
 
 
480 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.81 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.94 
 
 
485 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  40.94 
 
 
485 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.94 
 
 
485 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.65 
 
 
483 aa  220  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  45.65 
 
 
526 aa  219  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  40 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.87 
 
 
500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  34.86 
 
 
587 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.69 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.41 
 
 
471 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40 
 
 
525 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.33 
 
 
465 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.8 
 
 
532 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 
510 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.21 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.41 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.57 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  35.74 
 
 
499 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  38.71 
 
 
534 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 
502 aa  171  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  33.52 
 
 
499 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  34.72 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.6 
 
 
533 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.21 
 
 
517 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 
501 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.86 
 
 
515 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.49 
 
 
512 aa  160  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  33.4 
 
 
496 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
556 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 
546 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.42 
 
 
492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.48 
 
 
513 aa  156  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
499 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 
519 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.65 
 
 
521 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.05 
 
 
492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 
512 aa  153  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 
496 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 
528 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.41 
 
 
517 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  29.35 
 
 
463 aa  151  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  31.96 
 
 
488 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  35.26 
 
 
502 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.77 
 
 
499 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  35.24 
 
 
499 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.38 
 
 
492 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.41 
 
 
496 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.82 
 
 
514 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  31.96 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.68 
 
 
556 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.9 
 
 
513 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.96 
 
 
524 aa  148  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.83 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.53 
 
 
492 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.75 
 
 
513 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.48 
 
 
506 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  34.64 
 
 
499 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 
525 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.1 
 
 
528 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  33.83 
 
 
506 aa  146  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 
494 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  29.28 
 
 
498 aa  146  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.13 
 
 
499 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.13 
 
 
514 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 
494 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.41 
 
 
508 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.72 
 
 
514 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.88 
 
 
527 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  26.68 
 
 
511 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.11 
 
 
501 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  33.08 
 
 
530 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 
494 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 
521 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.1 
 
 
514 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>