More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5185 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 497 aa  943    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  65.99 
 
 		 490 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  58.57 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.43 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  55.66 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.6 
 
 		 495 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.42 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.45 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.1 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  49.13 
 
 		 473 aa  322  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.49 
 
 		 511 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.9 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.7 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  45.05 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.05 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.05 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  47.08 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  46.69 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.42 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.02 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.94 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.08 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.92 
 
 		 536 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.6 
 
 		 465 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  47.96 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.31 
 
 		 471 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.14 
 
 		 501 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.79 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.01 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.55 
 
 		 500 aa  227  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  42.96 
 
 		 507 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.79 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.09 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.56 
 
 		 519 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.88 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.67 
 
 		 526 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  33.53 
 
 		 512 aa  207  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  40.39 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  40.03 
 
 		 576 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  36.28 
 
 		 496 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.27 
 
 		 524 aa  192  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.78 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.92 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.13 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 		 524 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.55 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.2 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.8 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.73 
 
 		 521 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.55 
 
 		 517 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 512 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.8 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.32 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  35.64 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  32.17 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.92 
 
 		 499 aa  183  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 		 507 aa  183  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.6 
 
 		 499 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  36.77 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 		 525 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.23 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  30.47 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.41 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  36.53 
 
 		 535 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.23 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.12 
 
 		 524 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  33.27 
 
 		 515 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  25.74 
 
 		 499 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.75 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.53 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.56 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.66 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.39 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.45 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  30.77 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.18 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.35 
 
 		 496 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  34.33 
 
 		 499 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 		 523 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 494 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.33 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.96 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.24 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.65 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  36.53 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 		 494 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.37 
 
 		 490 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 		 524 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>