More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0345 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
495 aa  925    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  59.8 
 
 
497 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  58.62 
 
 
490 aa  435  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.76 
 
 
494 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  56.8 
 
 
497 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.98 
 
 
487 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.12 
 
 
511 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  57.91 
 
 
533 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.72 
 
 
485 aa  316  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.85 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  49.66 
 
 
473 aa  307  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  46.82 
 
 
476 aa  306  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.17 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.79 
 
 
480 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  47.46 
 
 
485 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.46 
 
 
485 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.46 
 
 
485 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.64 
 
 
470 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  46.65 
 
 
481 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.98 
 
 
471 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.01 
 
 
536 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.9 
 
 
499 aa  276  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.3 
 
 
501 aa  269  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.74 
 
 
483 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.22 
 
 
504 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.68 
 
 
465 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  48.42 
 
 
534 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.22 
 
 
495 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  46.38 
 
 
507 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.4 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.97 
 
 
526 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.89 
 
 
500 aa  213  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.81 
 
 
517 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.98 
 
 
512 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.14 
 
 
512 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  46.44 
 
 
525 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.01 
 
 
509 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
519 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.69 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 
524 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  41.13 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  35.42 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.44 
 
 
521 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 
492 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.52 
 
 
524 aa  193  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.8 
 
 
533 aa  193  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.37 
 
 
530 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.47 
 
 
494 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.96 
 
 
499 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.48 
 
 
499 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.1 
 
 
499 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  42.31 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.05 
 
 
530 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  31.87 
 
 
463 aa  190  5.999999999999999e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 
499 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.79 
 
 
499 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 
499 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.79 
 
 
511 aa  189  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.86 
 
 
525 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 
502 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 
523 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.24 
 
 
494 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.15 
 
 
504 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 
510 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 
494 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  42.24 
 
 
558 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  41.81 
 
 
526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.31 
 
 
524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 
500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  34.51 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.02 
 
 
524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 
521 aa  183  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.61 
 
 
499 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  29.28 
 
 
466 aa  182  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.33 
 
 
524 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.1 
 
 
502 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  36.41 
 
 
496 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.82 
 
 
556 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  32.26 
 
 
515 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.92 
 
 
515 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.11 
 
 
524 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  34.21 
 
 
504 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.02 
 
 
508 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.96 
 
 
556 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.41 
 
 
514 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.41 
 
 
492 aa  180  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  34.21 
 
 
504 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.62 
 
 
512 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  34.01 
 
 
504 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 
520 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  32.07 
 
 
508 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 
511 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 
529 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.62 
 
 
496 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.41 
 
 
519 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.13 
 
 
518 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>