More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6012 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 511 aa  947    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  67.93 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  50.38 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.1 
 
 		 494 aa  349  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  51.38 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  48.8 
 
 		 533 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.69 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.5 
 
 		 487 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.83 
 
 		 497 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  46.14 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.37 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  44.62 
 
 		 481 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  43.42 
 
 		 473 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.7 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.25 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.04 
 
 		 536 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.77 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  41.77 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.77 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.04 
 
 		 471 aa  259  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.94 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.83 
 
 		 504 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.67 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.43 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.63 
 
 		 495 aa  217  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.59 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.45 
 
 		 526 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.56 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.04 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  38.4 
 
 		 499 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 		 519 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  36.76 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.21 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.32 
 
 		 528 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 		 515 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  31.48 
 
 		 508 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.06 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  38.56 
 
 		 576 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  34.45 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.6 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.88 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.38 
 
 		 514 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  42.49 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.63 
 
 		 525 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.23 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.19 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.26 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.22 
 
 		 532 aa  177  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 		 507 aa  177  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  25.14 
 
 		 499 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.85 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.32 
 
 		 521 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  35.69 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.82 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  37.11 
 
 		 499 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  35.09 
 
 		 500 aa  170  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 		 521 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.4 
 
 		 501 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.47 
 
 		 517 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.75 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  37.03 
 
 		 499 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  33.07 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  37.72 
 
 		 519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.95 
 
 		 490 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.88 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.68 
 
 		 513 aa  167  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.75 
 
 		 499 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.48 
 
 		 533 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.22 
 
 		 522 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.68 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.85 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.67 
 
 		 519 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  32.39 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 		 546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  34.29 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.98 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.02 
 
 		 499 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  24.62 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.52 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.38 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 521 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.9 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  31.01 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.4 
 
 		 499 aa  160  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.44 
 
 		 502 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 		 499 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.32 
 
 		 514 aa  159  8e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.89 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.89 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  29.9 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.84 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.42 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>