116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5999 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1035  nitroreductase  54.46 
 
 
226 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.67 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  25.53 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  24.51 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.64 
 
 
167 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.76 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.11 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  24.58 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  22.8 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.24 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  24.89 
 
 
261 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  24.89 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.32 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.61 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.92 
 
 
167 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.05 
 
 
269 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  22.5 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  24.87 
 
 
173 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  22.63 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  23.53 
 
 
265 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  40.26 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.56 
 
 
184 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  42.03 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.85 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30.54 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.88 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  25 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  34.67 
 
 
183 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  20.5 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.83 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  20.59 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  25.49 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.42 
 
 
194 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  44.68 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.27 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  24.63 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  25.6 
 
 
201 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.08 
 
 
226 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  34.91 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  24.23 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  29.34 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.62 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.01 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  30.39 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.26 
 
 
170 aa  46.2  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  29.67 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.19 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  26 
 
 
348 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.11 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  26.07 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  24.77 
 
 
350 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  33.33 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  24.16 
 
 
189 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  26.46 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  26.94 
 
 
411 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  40.43 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  40.43 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  42.86 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.81 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  26.46 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  26.94 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.46 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  26.94 
 
 
394 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.09 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  25.14 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  40.43 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  35.8 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.4 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  24.85 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  33.9 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  25 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  32.26 
 
 
167 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.71 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  36.36 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.5 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  38.1 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  40.32 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.21 
 
 
165 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.66 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.02 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4520  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.32 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  42.31 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  32.5 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25.52 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25.52 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  34.33 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  24.19 
 
 
174 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.18 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  23.96 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  33.01 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  26.42 
 
 
368 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  23.91 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  35.29 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  27.57 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  24.75 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  28.34 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>