143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1900 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  100 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  66.28 
 
 		 269 aa  353  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  64.73 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  60.8 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  61.39 
 
 		 261 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  49.24 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.68 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.53 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.68 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.55 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.82 
 
 		 814 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  27.23 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.55 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.2 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.45 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.9 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0333  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.23 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.9 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.5 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  24.89 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.4 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.29 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.97 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.63 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.53 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.48 
 
 		 584 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.14 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 		 1580 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.73 
 
 		 187 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.79 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.33 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.36 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.56 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.69 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.6 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  25 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  40 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  34.94 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.48 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  25.54 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  41.67 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.66 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.36 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  20 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.64 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  40.62 
 
 		 167 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.32 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.89 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  40 
 
 		 204 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.1 
 
 		 221 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.11 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.9 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  44.26 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.21 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.7 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  20.63 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  24.45 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  24.6 
 
 		 982 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.1 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.1 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.23 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.1 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.11 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  22.12 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.69 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.68 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  42.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  41.03 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.51 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.74 
 
 		 190 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.88 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  31.45 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.73 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  21.43 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3749  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.05 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.219924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  35.29 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.99 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.33 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.18 
 
 		 167 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  30.26 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  37.5 
 
 		 174 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  24.19 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  42.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  41.18 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  34.94 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  41.18 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  24.5 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  41.18 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  36.67 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  40.62 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>