52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0333 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0333  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  488  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  29.39 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.11 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  24.56 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  27.14 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.35 
 
 
186 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  25 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.11 
 
 
184 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  24.75 
 
 
276 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.88 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.78 
 
 
350 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  23.83 
 
 
190 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  21.81 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25.79 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  23.18 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.08 
 
 
183 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  21.93 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  26.67 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.63 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  26.89 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  20.69 
 
 
170 aa  48.5  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  24.42 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  27.19 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24 
 
 
584 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  20.37 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  28.33 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  22.36 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  22.22 
 
 
190 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  26.89 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  24.88 
 
 
190 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  38.33 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  42.22 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  37.29 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  29.32 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  25.12 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25.25 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  21.63 
 
 
165 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  22.84 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  23.04 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  24.27 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.5 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  22 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  37.7 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  21.46 
 
 
186 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  32.81 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  28.74 
 
 
240 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  28.74 
 
 
240 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  22.71 
 
 
203 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.58 
 
 
166 aa  42  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  20.6 
 
 
251 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  20.6 
 
 
251 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  22.41 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>