160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1902 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  86.06 
 
 		 261 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  68.46 
 
 		 269 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  68.08 
 
 		 276 aa  348  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  61.39 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  50.97 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0333  hypothetical protein  24.56 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.22 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.77 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.75 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.9 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.9 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.75 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.56 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  24.15 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.5 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.42 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  21.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  25.43 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  44.44 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.86 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.64 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  21.07 
 
 		 194 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  22.98 
 
 		 181 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  22.98 
 
 		 181 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  45 
 
 		 169 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.53 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  41.27 
 
 		 186 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  25.76 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.88 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.03 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.8 
 
 		 204 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  23.11 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  41.27 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  46.67 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  40.98 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  42.37 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  41.51 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  42.55 
 
 		 180 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  35.94 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  24.68 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0684  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.49 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.11 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.67 
 
 		 165 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  38.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.14 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  54.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  22.55 
 
 		 343 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.37 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  21.28 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.69 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.21 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  54.76 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.58 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  39.22 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.1 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.53 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.14 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.51 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.62 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.65 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  37.7 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  42.31 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  39.06 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  39.68 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  28.32 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  37.31 
 
 		 178 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.56 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.89 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  25.78 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  24.35 
 
 		 982 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  23.53 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  44.9 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  34.57 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  24.07 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  32.86 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  31.63 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  40 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  39.68 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  32.89 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  44.44 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  52.38 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  24.02 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.44 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3233  nitroreductase  43.48 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  33.77 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.21 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 1580 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.87 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>