111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1139 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  68.71 
 
 
343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  61.99 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  60.95 
 
 
343 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  60.23 
 
 
343 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  60.95 
 
 
343 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  60.95 
 
 
343 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  60.95 
 
 
343 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  61.24 
 
 
343 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  60.95 
 
 
343 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  62.35 
 
 
335 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  61.59 
 
 
335 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  60.53 
 
 
343 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  46.67 
 
 
361 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  33.53 
 
 
339 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  42.17 
 
 
375 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  43.12 
 
 
376 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  38.55 
 
 
380 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  42.81 
 
 
377 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  41.29 
 
 
315 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  35.09 
 
 
323 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  33.54 
 
 
349 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  35.51 
 
 
333 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  34.15 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  32.15 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  34.59 
 
 
324 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  35.22 
 
 
324 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  35.82 
 
 
332 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  33.23 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  35.14 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  28.26 
 
 
330 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  36.11 
 
 
331 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  36.88 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  30.75 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  30.43 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  33.85 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  32.66 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  32.62 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  32.49 
 
 
344 aa  132  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  30.12 
 
 
368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  30.82 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  36.56 
 
 
342 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  30.82 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  34.43 
 
 
343 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  35.45 
 
 
349 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  31.72 
 
 
326 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  33.04 
 
 
359 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  31.54 
 
 
320 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  29.88 
 
 
330 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  32.49 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  34.47 
 
 
346 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  33.23 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  33.23 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  33.23 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  34.65 
 
 
325 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  32.7 
 
 
382 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  30.79 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  32.08 
 
 
380 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  31.4 
 
 
330 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  30.29 
 
 
332 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  31.1 
 
 
330 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  31.1 
 
 
330 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  29.69 
 
 
327 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  29.15 
 
 
332 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  30.46 
 
 
326 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  30.03 
 
 
335 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  30.46 
 
 
326 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  30.03 
 
 
335 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  30.46 
 
 
326 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  32.41 
 
 
318 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  32.41 
 
 
318 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  29.81 
 
 
335 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  32.41 
 
 
318 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  30.72 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  28.53 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  29.46 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  28.4 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  29.51 
 
 
344 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  30.94 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  25.44 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  31.36 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.26 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  23.48 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  27.99 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  26.49 
 
 
1006 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  25.56 
 
 
679 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  30.07 
 
 
402 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  25.63 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  24.47 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  27.86 
 
 
730 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  30.34 
 
 
817 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  37.29 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  41.11 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  28.88 
 
 
726 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  32.28 
 
 
989 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  22.3 
 
 
770 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>