129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1889 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  86.06 
 
 
261 aa  445  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  71.03 
 
 
269 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  70.08 
 
 
276 aa  357  9e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  60.8 
 
 
276 aa  327  9e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  51.81 
 
 
265 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0333  hypothetical protein  27.14 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.1 
 
 
184 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.74 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.3 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  24.89 
 
 
218 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  22.86 
 
 
186 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.36 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.58 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  26.58 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.63 
 
 
180 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.21 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.51 
 
 
235 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  23.11 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.66 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  42 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.29 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  20.18 
 
 
192 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.22 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24 
 
 
204 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.71 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.58 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.54 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  26.44 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.61 
 
 
170 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.81 
 
 
210 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.9 
 
 
228 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0684  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.14 
 
 
214 aa  48.9  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  32.84 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  35.37 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.51 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.84 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.39 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  25.59 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  41.27 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25.26 
 
 
348 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.81 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  20.35 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  50 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.21 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.68 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  22.81 
 
 
343 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  52.78 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25 
 
 
181 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25 
 
 
181 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  23.19 
 
 
228 aa  47  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.18 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.51 
 
 
180 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  30.3 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  40.68 
 
 
167 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  40.85 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  24.78 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.97 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  33.77 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  24.24 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  22.48 
 
 
191 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  23.96 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  35.38 
 
 
280 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  47.73 
 
 
169 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0271  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.5 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.64 
 
 
209 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35 
 
 
170 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  38.89 
 
 
167 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  29.63 
 
 
225 aa  45.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  34.38 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  28.45 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.62 
 
 
228 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  31.91 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  50 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  35.23 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.5 
 
 
584 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  43.48 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  34.83 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  25.89 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  23.25 
 
 
368 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  47.73 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.53 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  37.04 
 
 
175 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  23.68 
 
 
351 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  27.88 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  24.53 
 
 
394 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  43.48 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  22.27 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.11 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  38.78 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>