110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1686 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1889  nitroreductase  70.08 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.847236  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  66.67 
 
 		 269 aa  359  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1902  nitroreductase  68.08 
 
 		 261 aa  347  8e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.453048  hitchhiker  0.00100837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1900  nitroreductase  64.73 
 
 		 276 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.743117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  50.58 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  25.53 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.08 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0333  hypothetical protein  24.75 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.86 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.92 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.34 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.94 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  36.51 
 
 		 180 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  22.56 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.34 
 
 		 584 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  35.29 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.53 
 
 		 187 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  26.64 
 
 		 348 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25.22 
 
 		 196 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.25 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  23.25 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.9 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  41.67 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1863  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.79 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000280674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.89 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.8 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  38.71 
 
 		 197 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  25.51 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  27.73 
 
 		 195 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.78 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  21.22 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  24 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.53 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  40.68 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  20.55 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  37.1 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  40.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  33.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  36.49 
 
 		 167 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.3 
 
 		 167 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  35.06 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  23.61 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  24.14 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  26.61 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  20.25 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  24.36 
 
 		 217 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  27.23 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  42.11 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  42.11 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  19.18 
 
 		 192 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42.59 
 
 		 814 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.07 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  25.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  40.62 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 982 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  34.38 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  28.97 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0641  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.64 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.614962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.2 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  38.78 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.79 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.16 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  26.55 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.9 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  23 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  21.79 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  25.89 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  22.97 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.92 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.92 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  33.33 
 
 		 189 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  33.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.9 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.41 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  40.98 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.48 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.41 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.18 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  22.86 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  21.6 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.55 
 
 		 197 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  33.87 
 
 		 201 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  36.67 
 
 		 169 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  40.82 
 
 		 173 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.66 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  35 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  26.91 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>