More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5917 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 213 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 213 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 213 aa  341  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  82.9 
 
 		 193 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  40.69 
 
 		 222 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  34.55 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.47 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 216 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  45.22 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.32 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2598  hypothetical protein  44.07 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
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NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  26.32 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  30.54 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
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