146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5806 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.93 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  76.04 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  76.04 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  76.04 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  61.54 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  53.78 
 
 		 351 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  42.65 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  45.37 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  34.42 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  48.24 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.24 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.24 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  34.27 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  28.49 
 
 		 222 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  37.1 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  26.19 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  30 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  30.94 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.26 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  34.48 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  34.53 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  23.92 
 
 		 212 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  27.51 
 
 		 213 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  19.18 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  26.99 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  27.19 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.64 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  31.87 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  24.26 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  31.85 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  28.23 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  25.76 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.15 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.35 
 
 		 774 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  27.44 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  24.62 
 
 		 801 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  26.32 
 
 		 813 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  23.4 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  24.87 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  25.42 
 
 		 793 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  21.96 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  18.97 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  25.71 
 
 		 811 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  24.52 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  24.61 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  24.61 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  27.01 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  23.35 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  24.64 
 
 		 800 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 		 816 aa  56.2  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  26.5 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  26.5 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  25.37 
 
 		 806 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  26.83 
 
 		 1168 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  27.35 
 
 		 232 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  31.2 
 
 		 820 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  25.29 
 
 		 224 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 208 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  21.51 
 
 		 781 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  26.26 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  25.71 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  28.21 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25.42 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.55 
 
 		 839 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  22.41 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  27.63 
 
 		 1232 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  26.5 
 
 		 259 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  28.95 
 
 		 804 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  23.56 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  22.45 
 
 		 1136 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  24.55 
 
 		 1180 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  19.7 
 
 		 807 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  24.32 
 
 		 819 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  24.44 
 
 		 219 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  25.97 
 
 		 213 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  22.53 
 
 		 801 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  26.96 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  25.78 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  20.34 
 
 		 1216 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  22.94 
 
 		 1199 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  30.96 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  29.22 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>