163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3360 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  40.11 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  27.03 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  31.14 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  27.43 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 317 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  25.45 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.73 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  24.87 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  30.57 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  32.04 
 
 		 390 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  25.77 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  22.77 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  23.68 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>