122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0759 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  70.77 
 
 		 595 aa  792    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  80.43 
 
 		 560 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  61.71 
 
 		 582 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  59.5 
 
 		 574 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  59.68 
 
 		 591 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  80.43 
 
 		 560 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 566 aa  1147    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.14 
 
 		 593 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  80.43 
 
 		 560 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  91.99 
 
 		 574 aa  1073    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  63.03 
 
 		 577 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  61.44 
 
 		 601 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  76.87 
 
 		 626 aa  876    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  62.3 
 
 		 586 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  59.61 
 
 		 593 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  60.49 
 
 		 622 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  63.6 
 
 		 575 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  69.53 
 
 		 563 aa  761    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  59.11 
 
 		 593 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  60.97 
 
 		 565 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  60.44 
 
 		 618 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.07 
 
 		 606 aa  642    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  60.29 
 
 		 628 aa  634    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  67.66 
 
 		 572 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  57.14 
 
 		 599 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  68.73 
 
 		 592 aa  757    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.54 
 
 		 589 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.89 
 
 		 606 aa  637    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  58.51 
 
 		 621 aa  636    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  58.87 
 
 		 598 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  59.28 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  58.26 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  48.43 
 
 		 594 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  46.95 
 
 		 598 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  47.47 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  40.96 
 
 		 559 aa  341  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  30.28 
 
 		 477 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 		 471 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 		 471 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  31.06 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  29.53 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  28.72 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 		 472 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 		 472 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.19 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29 
 
 		 465 aa  147  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  30.4 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  26.5 
 
 		 466 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.26 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  27.27 
 
 		 434 aa  135  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  27.67 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.37 
 
 		 435 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.14 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  32.49 
 
 		 429 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  27.08 
 
 		 438 aa  97.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 		 601 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  29.35 
 
 		 622 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  23.63 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  23.99 
 
 		 698 aa  73.6  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.67 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.47 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  23.81 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  23.88 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  22.47 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25.06 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.33 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  19.42 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.69 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 		 899 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.1 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.81 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 932 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  24.67 
 
 		 517 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 932 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.62 
 
 		 444 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  24.46 
 
 		 580 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 995 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 		 494 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  23.06 
 
 		 945 aa  50.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 649 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  20.5 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  24.02 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  24.04 
 
 		 791 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 		 652 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  23.1 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  23.1 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.93 
 
 		 666 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>