More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5566 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5566  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 348 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  72.56 
 
 		 717 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  72.56 
 
 		 718 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  72.92 
 
 		 723 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1486  OmpA/MotB domain protein  67.86 
 
 		 666 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0695  OmpA/MotB domain-containing protein  67.21 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3622  OmpA/MotB  55.05 
 
 		 673 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0476  OmpA/MotB  55.91 
 
 		 697 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66276  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0321  OmpA/MotB  58.11 
 
 		 651 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  56.27 
 
 		 617 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0211  OmpA/MotB domain protein  59.31 
 
 		 306 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0237  OmpA family protein  58.64 
 
 		 727 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2802  OmpA/MotB  50.3 
 
 		 663 aa  285  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2055  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 742 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.124789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1587  OmpA/MotB domain-containing protein  44.57 
 
 		 720 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.068035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  43.38 
 
 		 742 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4324  OmpA/MotB domain-containing protein  44.03 
 
 		 711 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2288  OmpA/MotB domain protein  41.48 
 
 		 739 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  36.93 
 
 		 703 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2068  OmpA family protein  39.93 
 
 		 880 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  42.8 
 
 		 701 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.44 
 
 		 701 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0330  OmpA/MotB domain-containing protein  40.67 
 
 		 730 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.68 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  31.88 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  44.87 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 		 227 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  38.96 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.62 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.72 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.03 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  41.43 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  41.33 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  31.9 
 
 		 575 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.7 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2862  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.97 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 543 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  46.15 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  34.74 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  37.62 
 
 		 630 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  46.15 
 
 		 269 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  44.87 
 
 		 262 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.29 
 
 		 218 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 544 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.5 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  38.18 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 263 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 216 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 229 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  31.53 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  33.64 
 
 		 185 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  39.74 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  47.22 
 
 		 1619 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  26.05 
 
 		 261 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  24.56 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  44.78 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  32.38 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  34.91 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33.96 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  25.63 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.75 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.09 
 
 		 542 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.61 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.21 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.21 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.88 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>