More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4721 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  79.74 
 
 		 472 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  81.9 
 
 		 469 aa  725    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  100 
 
 		 463 aa  907    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  36.74 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  35.91 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  34.79 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  34.42 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  37.87 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  33.7 
 
 		 472 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 472 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  36.34 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  36.93 
 
 		 474 aa  285  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  29.08 
 
 		 475 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  27.7 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.29 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.25 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.49 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.84 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  27.99 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25.51 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  28.2 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.82 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.82 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.88 
 
 		 461 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.88 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.67 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.33 
 
 		 533 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.72 
 
 		 526 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  26.75 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.83 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  27.15 
 
 		 506 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  21.36 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  23.94 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.09 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  23.71 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  25.85 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2834  Na+/solute symporter  25.34 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00723472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  23.56 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.54 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.54 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  23.7 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  23.47 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  23.47 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  23.47 
 
 		 516 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  23.32 
 
 		 516 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  22.07 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1569  hypothetical protein  22.06 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  23.06 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.24 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  24.33 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.02 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.77 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  24.62 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  22.87 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.68 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.71 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.06 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.92 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  23.06 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  21.96 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1898  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.14 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  21.76 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  22.83 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  22.61 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.14 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.55 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  23.19 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.36 
 
 		 557 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  22.36 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  22.36 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  22.36 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  22.61 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  21.45 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  21.45 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.04 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.19 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  21.45 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  21.45 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  21.45 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  21.45 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  21.45 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  21.45 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  22.98 
 
 		 551 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  21.28 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>