90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5452 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  100 
 
 		 1096 aa  2142    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1032 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1032 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1353 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1263 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1248 aa  363  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  34 
 
 		 1190 aa  362  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1203 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1192 aa  335  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  30.07 
 
 		 1160 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  27.28 
 
 		 1285 aa  207  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  27 
 
 		 1164 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  33.93 
 
 		 1115 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  40.85 
 
 		 669 aa  148  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  50.99 
 
 		 783 aa  148  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1127 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  33.84 
 
 		 457 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  46.58 
 
 		 871 aa  115  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  42.67 
 
 		 237 aa  108  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  40.69 
 
 		 671 aa  105  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  45.74 
 
 		 255 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.89 
 
 		 701 aa  92.8  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  38.32 
 
 		 921 aa  90.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  46 
 
 		 915 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  33.61 
 
 		 914 aa  87.8  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1268 aa  85.1  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  39.16 
 
 		 908 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  53.01 
 
 		 139 aa  78.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  44.54 
 
 		 881 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  43.7 
 
 		 859 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  43.7 
 
 		 859 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  44.54 
 
 		 881 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  44.88 
 
 		 853 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  44.88 
 
 		 857 aa  76.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  43.59 
 
 		 794 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  43.7 
 
 		 881 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  44.09 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  44.09 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  37.21 
 
 		 968 aa  75.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  62.07 
 
 		 1120 aa  75.5  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  35.66 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  46.15 
 
 		 870 aa  75.1  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  40.52 
 
 		 849 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  40.34 
 
 		 881 aa  72  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  25.93 
 
 		 913 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  27.31 
 
 		 957 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  36.79 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  33.33 
 
 		 1167 aa  67  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  35.67 
 
 		 1122 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  35.95 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  35.95 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  30 
 
 		 1835 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  29.68 
 
 		 1906 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5701  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  31.79 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  34 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  30.04 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  32.37 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  44.44 
 
 		 1628 aa  59.3  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  36.72 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  35.95 
 
 		 370 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  26.51 
 
 		 738 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  32.48 
 
 		 291 aa  57  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  28.74 
 
 		 732 aa  56.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  32.46 
 
 		 290 aa  56.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  30.66 
 
 		 276 aa  55.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  35.29 
 
 		 360 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  34.9 
 
 		 339 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  31.79 
 
 		 314 aa  54.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  28.99 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  46.15 
 
 		 811 aa  53.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  30.95 
 
 		 371 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  31.52 
 
 		 1364 aa  52  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  42.35 
 
 		 647 aa  51.6  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  35.66 
 
 		 1222 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  27.81 
 
 		 360 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.31 
 
 		 1343 aa  48.5  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  28.86 
 
 		 970 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  29.31 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  36.81 
 
 		 377 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  38.89 
 
 		 781 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  28.74 
 
 		 381 aa  47.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  33.58 
 
 		 346 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  28.74 
 
 		 381 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  33.61 
 
 		 364 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 406 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  29.07 
 
 		 435 aa  45.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>