More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0184 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.17 
 
 
695 aa  865    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
667 aa  1358    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  61.35 
 
 
701 aa  837    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  59.58 
 
 
903 aa  812    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.11 
 
 
669 aa  815    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  43.91 
 
 
825 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.56 
 
 
825 aa  505  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.4 
 
 
684 aa  484  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.54 
 
 
820 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.22 
 
 
697 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.65 
 
 
688 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.22 
 
 
727 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.05 
 
 
699 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.62 
 
 
816 aa  390  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.98 
 
 
811 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.95 
 
 
810 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.39 
 
 
811 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.17 
 
 
811 aa  359  7e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  34.02 
 
 
723 aa  180  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  32.84 
 
 
799 aa  170  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  32.09 
 
 
760 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
756 aa  164  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  33.33 
 
 
712 aa  162  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  31.41 
 
 
726 aa  160  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  32.43 
 
 
729 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  31.67 
 
 
727 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.56 
 
 
710 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
706 aa  158  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 
729 aa  152  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 
708 aa  151  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  32.49 
 
 
824 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 
709 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.76 
 
 
791 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.6 
 
 
799 aa  140  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
707 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 
751 aa  139  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 
707 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
707 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.87 
 
 
693 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.81 
 
 
746 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  30.77 
 
 
808 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.52 
 
 
747 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.52 
 
 
747 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
739 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.7 
 
 
715 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.18 
 
 
694 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
700 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
657 aa  112  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.84 
 
 
1004 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.32 
 
 
893 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.37 
 
 
1265 aa  104  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.91 
 
 
662 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.85 
 
 
780 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.92 
 
 
932 aa  100  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 
807 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.57 
 
 
827 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
837 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.9 
 
 
1053 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.94 
 
 
1767 aa  95.5  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.51 
 
 
800 aa  94.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 
852 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.61 
 
 
852 aa  94  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.79 
 
 
847 aa  94  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 
852 aa  94  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.61 
 
 
817 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.26 
 
 
785 aa  93.2  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.03 
 
 
1465 aa  93.2  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 
988 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  24.94 
 
 
904 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.56 
 
 
916 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.13 
 
 
803 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.85 
 
 
874 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.12 
 
 
851 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.73 
 
 
837 aa  91.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  26.58 
 
 
842 aa  89.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26 
 
 
1004 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  27.25 
 
 
853 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.98 
 
 
831 aa  87.8  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  23.19 
 
 
901 aa  87.8  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  26.78 
 
 
885 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.25 
 
 
856 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 
952 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.04 
 
 
950 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 
1230 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.28 
 
 
889 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.65 
 
 
876 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  24.51 
 
 
909 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.23 
 
 
838 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.76 
 
 
853 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.49 
 
 
847 aa  84.3  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.06 
 
 
708 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 
937 aa  84  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  26.88 
 
 
869 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.16 
 
 
832 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.68 
 
 
1231 aa  82  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.25 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.76 
 
 
912 aa  82  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 
928 aa  82  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.5 
 
 
845 aa  81.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  26.14 
 
 
1060 aa  81.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>