106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5178 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 411 aa  808    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  75 
 
 		 398 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 377 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 362 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  27.39 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  31.58 
 
 		 373 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  27.54 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  27.2 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  24.49 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  28.2 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  28.53 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.74 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.97 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.99 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  28.45 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  30.49 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  25.59 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.91 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 191 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  20.42 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.31 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  29.77 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  29.39 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  22.36 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  34.19 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  48.28 
 
 		 578 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 363 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  27.2 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 187 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0524  hypothetical protein  29.45 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.82 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 227 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 360 aa  46.6  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  29.84 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  28.45 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  26.42 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 178 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 178 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.87 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 141 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.87 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  26.76 
 
 		 350 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>