254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4995 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  58.24 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  59.59 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  55.67 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  54.45 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  48.4 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  53.3 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  41.58 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.73 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  40 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  40 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 261 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 477 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 477 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>