More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0785 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
258 aa  540  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  62.15 
 
 
256 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  56.81 
 
 
259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  61.11 
 
 
255 aa  316  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.2 
 
 
252 aa  265  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
318 aa  262  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  51.6 
 
 
340 aa  260  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  50.59 
 
 
309 aa  256  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  50.8 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.41 
 
 
292 aa  248  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
304 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.41 
 
 
283 aa  235  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
258 aa  232  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
264 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.52 
 
 
268 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
263 aa  209  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.22 
 
 
264 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
264 aa  201  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
264 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 
263 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 
278 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 
280 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.45 
 
 
253 aa  171  9e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 
249 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 
262 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  40.95 
 
 
233 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.69 
 
 
276 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.47 
 
 
262 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.95 
 
 
233 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.74 
 
 
253 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.74 
 
 
253 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.32 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  36.51 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
257 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  34.15 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  34.38 
 
 
283 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  36.47 
 
 
255 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 
240 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.08 
 
 
239 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.38 
 
 
233 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.08 
 
 
258 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 
253 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.14 
 
 
251 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.35 
 
 
250 aa  158  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  38.7 
 
 
251 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.25 
 
 
255 aa  158  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.51 
 
 
251 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.14 
 
 
251 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
238 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  38.7 
 
 
251 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  38.26 
 
 
251 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 
256 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.99 
 
 
279 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  38.7 
 
 
251 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  36.55 
 
 
251 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  36.8 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.72 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.96 
 
 
291 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.99 
 
 
247 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  38.26 
 
 
264 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.36 
 
 
241 aa  154  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.5 
 
 
254 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  37.99 
 
 
236 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.43 
 
 
245 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.83 
 
 
251 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  34.54 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.09 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  37.12 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.96 
 
 
254 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.07 
 
 
254 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.48 
 
 
234 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.83 
 
 
248 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.12 
 
 
247 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  37.71 
 
 
247 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.45 
 
 
252 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  37.96 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  34.87 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  34.31 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.32 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.35 
 
 
282 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.7 
 
 
249 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
282 aa  151  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.39 
 
 
251 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  37.12 
 
 
261 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.93 
 
 
259 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  35.22 
 
 
254 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  36.96 
 
 
251 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.39 
 
 
258 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.8 
 
 
267 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.13 
 
 
251 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  38.26 
 
 
253 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 
273 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  35.9 
 
 
238 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.07 
 
 
267 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.12 
 
 
246 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
272 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>