178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0121 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  100 
 
 		 436 aa  902    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  62.9 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  58.33 
 
 		 449 aa  551  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  58.68 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  57.64 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  37.15 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  34.33 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  33.72 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  30.28 
 
 		 1293 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  30.28 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  27.71 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  28.28 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  25.76 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.55 
 
 		 511 aa  155  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  26.79 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.28 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  27.93 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  27.15 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  28.27 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  27.95 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  27.37 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.52 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.52 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  26.83 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  25.4 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.92 
 
 		 496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  30.77 
 
 		 538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.56 
 
 		 424 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  24.72 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  26.14 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  25.89 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  26.91 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.81 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  25.93 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.64 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.71 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 722 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  24.95 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  25.62 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  25.62 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  25.62 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.72 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  25.28 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  24.32 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  24.42 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  24.64 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  23.05 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.68 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  23.54 
 
 		 519 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.44 
 
 		 1033 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.12 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.89 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  21.72 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  22.59 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  20.97 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  30.19 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  23.78 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  27.44 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  26.47 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  46.3 
 
 		 491 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  48.08 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  26.09 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  41.82 
 
 		 499 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  23.1 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  41.82 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  48.08 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  20.14 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  47.06 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  21 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  25.73 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  46.15 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  28.03 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  43.4 
 
 		 499 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  40 
 
 		 517 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  25.93 
 
 		 372 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  23.03 
 
 		 525 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  46.15 
 
 		 507 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  36.89 
 
 		 566 aa  50.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  22.12 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  26.19 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  38.18 
 
 		 504 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  45.1 
 
 		 509 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  38.18 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  47.06 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  45.1 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  25.41 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  22.02 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  24.39 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.82 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.17 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  34.07 
 
 		 506 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  25.87 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  49.09 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  38.98 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  49.09 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  44.26 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>