103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3814 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  75.33 
 
 		 549 aa  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  75.33 
 
 		 549 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  85.04 
 
 		 548 aa  918    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  75.33 
 
 		 549 aa  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 548 aa  1101    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  66.42 
 
 		 557 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  36.96 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.33 
 
 		 581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  27.94 
 
 		 606 aa  166  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 600 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  26.73 
 
 		 619 aa  143  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 635 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 592 aa  104  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 604 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.29 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 581 aa  97.8  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 611 aa  87  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.63 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  39.58 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  20.96 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  36.8 
 
 		 683 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  22.41 
 
 		 565 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  22.8 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.2 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.75 
 
 		 622 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 608 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 599 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  32 
 
 		 635 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 537 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  21.55 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 555 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 555 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 563 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 545 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  21.56 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.03 
 
 		 530 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  20.32 
 
 		 544 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.87 
 
 		 543 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 554 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.56 
 
 		 579 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 580 aa  51.2  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  19.47 
 
 		 533 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  22.62 
 
 		 551 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 543 aa  50.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.64 
 
 		 543 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 624 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 624 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 624 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.64 
 
 		 543 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.64 
 
 		 543 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 514 aa  50.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  22.62 
 
 		 551 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  22.29 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.91 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  22.32 
 
 		 541 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 526 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 528 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  21.26 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 533 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  26.9 
 
 		 568 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  17.95 
 
 		 555 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 525 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.66 
 
 		 552 aa  47.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  21.18 
 
 		 543 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.85 
 
 		 509 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6956  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  21.95 
 
 		 571 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 522 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  23.76 
 
 		 523 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 533 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 603 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  22.46 
 
 		 585 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 		 537 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  21.84 
 
 		 542 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 549 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  21.46 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  34.92 
 
 		 532 aa  45.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>