279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3287 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 199 aa  275  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 194 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 194 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 194 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  62.89 
 
 		 194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  41.08 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 205 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  43.58 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  37.84 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  28.41 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
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NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.9 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  20.73 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
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