More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2927 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  100 
 
 		 391 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  34.88 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  34.57 
 
 		 433 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  31.62 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  34.54 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  34.18 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  29.55 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  34.73 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  32.53 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.27 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  30.6 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  33.46 
 
 		 451 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.83 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  37.61 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.69 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.22 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  26.54 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.28 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28.11 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  32.11 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  29.37 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.66 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.16 
 
 		 370 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.73 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  29.96 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25.69 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.94 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.95 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.48 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.32 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.76 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.15 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  22.38 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.78 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.46 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.46 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.28 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.14 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.17 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2060  hypothetical protein  56.06 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.06 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.86 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.24 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.35 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.12 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.3 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.51 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.28 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.28 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.9 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.88 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.22 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.27 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.48 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.29 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.3 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.62 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.92 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.71 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  24.63 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.69 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  25.27 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  29.6 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  22.32 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  20.95 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  20.95 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  23.79 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  27.49 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.42 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  26.98 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  20.44 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.86 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.89 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.05 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  26.85 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.06 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.28 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  30.14 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.51 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.5 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  29.26 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  24.8 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>