More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2141 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2141  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.78 
 
 
576 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
927 aa  72  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.52 
 
 
707 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
836 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  31.94 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.34 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.32 
 
 
784 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  37.36 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.35 
 
 
1056 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.14 
 
 
818 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.28 
 
 
706 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  35.66 
 
 
1138 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
1276 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
784 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
1276 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
1297 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.71 
 
 
623 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
4079 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 
564 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
1192 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
593 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.28 
 
 
706 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
452 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.38 
 
 
573 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.25 
 
 
1694 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.28 
 
 
560 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
3560 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
3035 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0663  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
344 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
366 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
713 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
361 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
428 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.54 
 
 
1022 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
562 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
716 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
4489 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  30.17 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
361 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
250 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1421 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
305 aa  58.9  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.98 
 
 
582 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1094 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.03 
 
 
730 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  25 
 
 
743 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
422 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
523 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
711 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 
406 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
446 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
245 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 
406 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
750 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  26.67 
 
 
545 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.38 
 
 
1240 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.95 
 
 
988 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.19 
 
 
581 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
280 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
1056 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
414 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
162 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1211  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0177658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  31.36 
 
 
544 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
615 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 
1979 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.91 
 
 
1007 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
465 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
699 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  25.77 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.18 
 
 
439 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.13 
 
 
397 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
512 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 
508 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
385 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.2 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  27.91 
 
 
331 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  29.06 
 
 
442 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
1054 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>