More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01753 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 901 aa  1832    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  74.53 
 
 		 894 aa  1390    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3289  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 924 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 871 aa  330  7e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 861 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 861 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 861 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 861 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 861 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 852 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 861 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2660  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 979 aa  314  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.436942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 855 aa  307  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 869 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 849 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 847 aa  302  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 857 aa  302  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 875 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 869 aa  267  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 910 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.41 
 
 		 827 aa  264  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 891 aa  260  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 965 aa  248  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 953 aa  245  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 927 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 873 aa  244  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 928 aa  239  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 981 aa  238  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 873 aa  237  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 874 aa  237  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.77 
 
 		 880 aa  237  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 843 aa  235  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 935 aa  234  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 842 aa  233  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 879 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 944 aa  231  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 944 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 855 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 853 aa  228  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 841 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.87 
 
 		 853 aa  227  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 950 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 890 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 855 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 884 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 890 aa  221  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 904 aa  221  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 869 aa  220  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 853 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 853 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 838 aa  220  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1055 aa  218  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 901 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 853 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 924 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 890 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 876 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.28 
 
 		 877 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 1006 aa  214  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 866 aa  214  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 907 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 882 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 907 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 868 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 882 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 924 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 924 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 924 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  26.36 
 
 		 866 aa  210  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 894 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 937 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 892 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 935 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 836 aa  209  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 935 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 935 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.04 
 
 		 936 aa  206  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 909 aa  206  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 930 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 930 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 886 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 933 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 886 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 920 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 981 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  25.4 
 
 		 899 aa  200  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.29 
 
 		 914 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 909 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 952 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 906 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 906 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 906 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4016  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1015 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 896 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 800 aa  194  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 895 aa  193  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 956 aa  191  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 901 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 709 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>